在薩摩耶犬的生命中也經常受到疾病的困擾。 一些常見到疾病都經常出現在薩摩耶犬的生活中， 嚴重威脅者寵物狗的身體健康， 也嚴重影響了薩摩耶犬的正常生活。
骨關節發育不全是薩摩耶犬多發的骨關節疾病。 當薩摩耶犬股關節發育不全的時候， 因髖臼淺， 關節不能夠非常好地吻合在一起， 又因為大腿骨骨頭的形狀歪曲， 因而不能夠完全咬合。 當咬合進一步惡化的時候， 關節完全脫落， 便可能會出現骨關節脫臼。 這種疾病的遺傳性的因素要占70%， 剩下的30%是肥胖負擔重或者是肌肉不發達而引起的。
過敏性皮炎， 當受到黴菌， 灰塵， 滿蟲， 化學物質等多種的物質的影響時， 會引起薩摩耶犬皮膚發炎的疾病。 患病的薩摩耶犬頻繁搔撓， 劇烈瘙養， 偶爾會見啃咬患部。 反復搔撓的部位會脫毛， 皮膚會有抓傷， 或是皮膚發黑，
糖尿病， 初期尿量異常的增加， 因尿量的增加而口渴， 多飲。 食欲旺盛， 體重減輕， 但是因初期水腫， 不太容易被發現。 輕症可以通過食療， 運動控制血糖值。 犬糧則要換成熱量低， 抑制碳水化合物以及脂肪低的品種。 血糖值高時或者是食療， 運動均無法控制血糖的時候， 必須要注射胰島素。 這種情況之下， 需要終生持續的注射胰島素。
為了預防這些常見的疾病來騷擾寵物狗， 在日常生活中， 飼養者還需要加強對薩摩耶犬的管理和照顧。 保持薩摩耶犬有足夠合適的運動量， 增強身體體質， 來抵抗這些常見易患的疾病。
