眼部的疾病並不只出現在人類身上， 例如白內障、眼球膨脹、脈絡膜發育異常等疾病也出現在寵物狗身上。 蘇格蘭牧羊犬也同樣會受到眼部疾病的侵害， 而且蘇牧犬眼睛疾病早在50年前便有獸醫開始注意研究了。 經過專家研究表示， 蘇牧犬的這種所謂的眼部綜合症是可以被一個受過專業訓練的犬類眼科專家在幼犬幾周齡時便診斷發現的。
白內障是發生在狗狗眼球晶狀體的疾病， 是狗狗眼睛常見病裡的一個比較嚴重的， 因為它會引起狗狗的眼睛失明。 剛開始得白內障的時候， 狗狗並沒有明顯的視力不好的情況， 隨著晶狀體的透明性減弱， 慢慢視力就會受影響了。 如果狗狗的年紀比較大了， 那麼在平時就要注意觀察狗狗的眼球， 如果發現沒有以前亮了或是清澈了， 就要有這個意識狗狗有可能得了白內障。
結膜炎也是狗狗易患的眼部疾病， 患病的蘇牧犬表現為眼睛睜不開、流眼淚、眼睛發紅等情況。 因為結膜是覆蓋有眼睛表面阻擋外來刺激的一層保護膜， 所以對於外界的刺激最先引起的也都是結膜上的症狀， 比如有髒東西進到眼睛裡了、被煙熏了、被化學品噴進了眼睛， 最先引起的也就是結膜發炎了。
角膜炎有許多情況都是由於外傷的刺激引起的， 也有因為像犬瘟這些傳染病引起的併發症。 角膜應該是透明、清澈的， 在得角膜炎的時候， 狗狗的角膜就會變得混濁， 還會引起狗狗眼睛疼痛和流淚。 但與結膜炎的區別是狗狗的眼睛看起來應該不是那麼的紅， 主要的症狀是集中在眼球中間的角膜部分。
當主人發現蘇牧犬眼角經常有異常的分泌物，
