深部真菌病是指侵害皮膚、粘膜和內臟的真菌所引起的感染。 病原菌的種類有很多種。 這些病原菌廣泛存在於土壤、動物糞便、乳汁中， 犬主要通過接觸污染的土壤或經呼吸道、消化道而感染， 只有少數真菌具有接觸傳染性。 深部真菌病可發生於體內各臟器， 其病變特徵是：肉芽腫性炎症、壞死、膿腫、潰瘍、瘺管、結締組織增生和形成結節。 飼料中廣泛添加抗菌藥物， 可能是犬發生深部真菌病的重要原因。 犬易發生的幾種主要深部真菌病是：
【組織胞漿茵病】
其病原為莢膜組織胞漿菌。
臨床上發現犬呈現難以治癒的咳嗽或腹瀉時， 即應考慮本病。 如有條件應以莢膜組織胞漿菌素做皮內試驗， 還可做胸部X線透視、血清補體結合試驗、瓊脂擴散試驗等進行診斷。
兩性黴素B對本病有很好的療效， 總用量為4毫克/千克體重， 分為10次， 每隔兩日注射1次， 臨用前先以注射用水溶解， 再用葡萄糖鹽水稀釋成0.1%（毫克）後靜脈注射。 總量不能超過5毫克/千克體重， 否則可損害腎臟。 克黴唑（抗真菌1號）對本病也有良好的療效，
【球孢子茵病】
其病原為皮炎芽生菌。 本病可分為全身型和皮膚型兩種。 全身型主要表現為肺臟的疾病， 病犬精神沉鬱、發熱、厭食、消瘦及咳嗽。 剖檢病死犬時， 肺臟各葉都有結節和膿腫， 肺臟呈現灰白色或淡紅色斑紋狀， 並有局灶性或彌漫性硬變。 肉芽腫結節的中心發生壞死， 但不鈣化。 病變向周圍蔓延時， 可使支氣管和縱隔淋巴結腫大、化膿， 甚至引起胸膜炎。 皮膚型芽生菌病表現為單發性或多發性皮膚肉芽腫， 最後則在中心液化壞死和發生潰瘍。 胸部X線照片所見到的肺部末鈣化結節或硬變， 有助於該病的診斷。 最好對皮膚結節做活組織檢查。 從膿汁、痰液中鏡檢時，
【隱球菌病】
其病原為新形隱球菌。 它存在於泥土中， 可從土壤、馬糞、水果和乳汁中分離到。 犬的隱球菌病主要侵害腦、腦膜、鼻旁竇以及肺、脾、肌肉、關節、皮膚等部位， 引起病犬的運動失調， 轉圈運動， 行為異常， 跛行， 感覺過敏和鼻漏。 剖檢時， 于鼻旁竇、鼻甲骨、鼻腔以及腦有小的化膿灶， 腦膜有粘液膿性炎症。 耳、眼瞼和腳等部位可見皮下肉芽腫。 在臨床上發現病犬有不明原因的呼吸道和中樞神經系統的症狀時， 應考慮到隱球菌病的可能性。 如能迸一多做病原檢查、血清學試驗及病理組織學檢查，
【孢子絲菌病】
病原為申克氏孢子絲菌。 經創傷感染。 病變主要侵犯皮膚， 常發生於肢端， 並沿淋巴管蔓延， 形成典型的帶狀腫。 原發部位為堅實、無彈性、可移動、無壓痛的結節或肉芽腫， 結節部被毛脫落後， 可看到附有滲出物， 乾涸後形成結痂， 有的結節可形成膿腫， 破潰後形成潰瘍。 根據上述症狀可懷疑為本病。 為了確診， 可從未破潰的膿腫內採取病料， 進行分離培養， 若分離到病原菌， 即可確診。 碘化物對本病有特效。 可用碘化鉀內服， 日量4.4毫克/千克體重。 也可靜脈注射碘化鈉。 口服灰黃黴素， 劑量為20毫克/千克體重·日， 連用2～3周。 皮膚潰瘍處可用0.2%碘溶液加2%碘化鉀）溫敷。
【念珠菌病（鵝口瘡）】
其病原為白色念珠菌。 常存在于健康動物的消化道內。 幼齡和體質衰弱， 特別是長期飼喂抗菌添加劑或長期使用抗生素治療的動物， 都易感染發病。 病犬的臨床特徵是在口腔和食道粘膜上形成一個大的或數個小的隆起的軟斑， 軟斑表面覆蓋有黃白色偽膜， 剝離後露出容易出血的充血面。 對有上述症狀的病犬， 從粘膜和皮膚病變處刮取標本鏡檢， 如發現酵母細胞和纏結的菌絲體， 即可確診。 早期發現、早期治療對提高療效具有重要意義， 其治療方法可參照組織胞漿菌病。 為了預防本病， 最重要的是除去各種誘因， 長期使用抗菌添加劑的應停止飼喂。 抗菌劑使用時間過長的也應停止使用，以避免念珠菌的生長。也可不定期口服制黴菌素，劑量為60萬～100萬單位/日，連續服用5～7天。
抗菌劑使用時間過長的也應停止使用，以避免念珠菌的生長。也可不定期口服制黴菌素，劑量為60萬～100萬單位/日，連續服用5～7天。
