貓眼睛的顏色因品種、個體不同而有明顯差異, 眼睛的顏色決定於視網膜色素層的顏色視網膜色素層顏色的沉積是由遺傳基因決定的, 不同的品種有不同的遺傳基因, 因此眼睛的顏色不同貓眼睛的顏色雖然沒有被毛顏色那樣千變萬化、絢麗多彩, 但也有多種色彩, 常見的有黃色(從淺黃到深黃不一)、藍色、唬拍色、紫銅色、綠色、淺棕色等, 一般認為眼睛的顏色與被毛的顏色有一定的相關性。
例如波斯貓眼睛的顏色常與被毛顏色有關聯, 波斯貓兩眼的顏色是鴛鴦眼色(一隻藍色,
在觀察、評定貓的眼色時, 除應注意眼睛顏色的各種色彩外, 還應注意, 任何顏色均應越深、越純、兩眼顏色越均勻越好。