一、腸阻塞：
因為兔子會持續地理毛， 所以和貓一樣， 他們也會有毛球的問題。 但不像貓， 兔子不會嘔吐把毛球吐出來， 而吞下過多的毛球則可能會造成致命的腸道阻塞。 如果兔子顯示出食欲喪失、糞便的形狀變小， 最好去請教兔子獸醫的意見。
預防：
多幫兔子梳毛（減少被吞入體內的毛球）；提供足夠的運動空間和時間， 一個星期至少三十個小時；每天給予足夠的新鮮乾草；在日常飲食上逐漸增加新鮮蔬菜的量；在大量換毛期， 或是吃下其他人工合成物時， 餵食兔子化毛膏或通便劑。
二、腸道細菌的平衡：
兔子的消化道裡， 有著對他們健康有益的細菌。 如果這種有益的細菌因為被不新鮮的食物， 或是飲食的突然改變所擾亂， 造成腸胃不適， 那麼有害的細菌便可以趁虛而入， 甚至讓兔子致命。
預防：
把所有的兔子食物保存在乾冷的地方， 如果要換食物， 也要慢慢來， 先給一點點的新食物。 如果二十四小時內肚子沒有咕咕叫， 或是拉肚子的現象， 才可以再供應繼續這種。 如果兔子可以去戶外走動， 要隨時注意它是否吃下撒了殺蟲劑的植物， 或是有毒的植物。
三、感染性的細菌：
許多兔子疾病是由細菌所造成， 並非病毒， 一般可以用抗生素治療。 如果兔子有感冒的徵兆， 帶它去給熟知抗生素用法的獸醫看， 因為用在兔子身上的抗生素必須非常小心。
