斑馬魚的雌雄不難區分:雄斑馬魚魚體修長, 鰭大, 體色偏黃, 臀鰭呈棕黃色, 條紋顯著;雌魚魚體較肥大, 體色較淡, 偏藍, 臀鰭呈淡黃色, 懷卵期魚腹膨大明顯。
斑馬魚屬卵生魚類, 4月齡進入性成熟期, 一般用5月齡魚繁殖較好。 斑馬魚的繁殖週期約7天左右, 一年可連續繁殖6—7次, 而且產卵量高。
斑馬魚的繁殖比較容易。 繁殖用水要求pH6.5-7.5, 硬度6-8, 水溫25-26攝氏度。 由於斑馬的卵為無粘性的沉性卵, 並且斑馬魚和其他鯉科魚一樣會吃掉自己的卵。 所以大家應該在繁殖缸底鋪設一些可以將卵隱蔽起來的物品。
繁殖時可按雌雄魚1:2的比例防入繁殖缸內, 一般頭天晚上防入, 第二天上午或中午就可以產卵受精。 排完卵要將種魚撈出另養。 一條雌魚每次可排卵300-1000粒不等。 受精卵經2-3天可孵出仔魚, 再經2天仔魚開始遊動覓食, 開始先以“洄水”喂之, 10天后可改喂其他小型魚蟲。