不具加溫系統的小型水族箱中：以三分之一矽砂與Duplarit基肥的混合物為最底層， 加上三分之二洗過的矽砂， 直徑1～2釐米， 整個底層高度2～3公分。 在沒有底部加溫的水族箱裡， 我們需要將底層高度限制在較低的標準， 因為它缺乏提高溫度的功能， 因而會影響到水的迴圈。 藉由較低的高度或厚度， 我們能夠促進有限而必需的水流流動或交替。
裝有底部加溫系統的水族箱中：底層高度可達3～5公分， 因為經由加溫線， 水的溫度上升， 通過底層產生有效的水流，
在水族箱的早期階段， 每次換水的時候， 仔細的以清缸換水器沖洗底層是比較明智的， 尤其是靠近前面玻璃的部分， 這裡的底層有較快變黑的傾向。 以後， 等水草的根一旦擴散開來， 我們便可知道砂床腐爛的危機已經消失。
至此， 我們就會明白， 不論是草泥丸、有色砂石或粗石粒， 都和水族箱的底層搭不上關係。
這是水族迷們爭論的一個問題。 有人說它應該細到讓水底生活的魚類感覺到在上面很舒適。 其他的人又說它得夠粗， 以確定水流或迴圈可以通過底層， 才能防止水族箱的砂床腐敗或變黑。
表面上看來， 這兩種觀點都有一定的道理。 養鯰科魚類是可愛、有趣的魚類， 它們在水族箱中執行一項非常有用的功能， 它們以底層裡外的任何東西為食， 若這些東西不除去的話， 就可能腐爛而不利於水族箱。 粗狀、銳邊的砂石並不存在于它們的天然繁殖地， 在太粗糙的砂石層上， 它們可能損害自己味覺敏感的觸鬚， 這終究會導致它們無法進食而死亡。
由此看來， 水族箱底層的砂石要越細越好。 太粗的底砂(即砂直徑大於4釐米)， 是不可能被接受的：由於碎屑易於沈澱在粗石之間， 隨後便會被細菌分解開來。 時間一久， 碎屑小到一個程度時， 底層的水迴圈實際上就被堵塞住了。
它似乎形成一道細密的水泥層， 若要將您的手指在底層戳個洞， 好植入新的植物， 甚至都變得很困難。 若底層是屬於細質的砂， 碎屑會沉澱在砂床“上面”；然後在下次換水時， 就可以容易被吸起。
同時，
底層也不應太過細密，
因為這可能導致其所需的水迴圈完全崩潰。
基於此原因，
只要砂石或碎石直徑小於1釐米，
都不應該考慮在內。
