一、水質
海水水族箱以pH值8.2為最理想， 但是， 魚類在遊動時不斷地呼出二氧化碳， 加上細菌的氧化作用， 很難在水族箱裡培養能夠吸收二氧化碳並發生同化作用的海藻， 所以海水都會有逐漸酸化的傾向， 我們要經常測試PH值， 迅速得知PH值最好的方法是不要養太多魚， 不斷地把氧氣送進水裡， 並且將二氧化碳排出， 以生苔代替水族箱中的海藻。 另外， 如果氨氣或亞硝酸增加太多， 魚的呼吸會加快且不規則， 身體顏色逐漸改變， 食欲也減退， 像生病一樣。 必須找出原因， 加以改善， 不然魚很容易致病而死。
水質好壞是海水觀賞魚健康成活的重要因素， 因此需要定期進行抽換海水與去毒的工作。 此外， 海水溫度、密度、氣氛等均會引起魚的疾病。 還有必須考慮海水過濾系統硝化功能是否已建立， 這些都會導致水質不良而使魚類致病。
二、飼養密度
1、缺氧
飼養密度太高， 魚的呼吸作用， 消耗水中大量氧氣， 加上水中大量有機物聚積， 水中溶解氧含量下降， 魚浮在水面呼吸， 時間長了會使魚類死亡。
2、水質惡化
魚的飼養密度高， 必然使殘餌、排泄物增多， 篩檢程式負荷增加。 當其超載至不能勝任過濾工作時， 水質會急劇惡化， 魚的疾病增多， 時間稍長， 會造成魚的死亡。
三、氣溫變化
氣溫變化太大， 驟冷驟熱，
四、感染
1、引入新魚
海水觀賞魚在轉運的過程中， 由於包裝條件不良， 會造成它們體質虛弱， 而且運輸中溫度差異大， 加上外來的刺激因素， 導致它們在進入一個新環境之後很容易感染疾病。
2、外傷
某些魚類不宜共養， 否則會打鬥而受傷， 感染疾病。
五、營養不良
魚類與其他動物一樣， 需要各種營養（蛋白質、碳水化合物、脂肪、適量的維生素等）， 飼養中的珊瑚礁魚往往因營養問題而發生多種疾病：
1、脂肪性退化症
大多發生在年齡較大的魚類身上， 魚體過度癡肥， 體內積聚大量脂肪， 妨礙內臟正常的機能；
2、營養性白肌症
以幼針發生較多， 原因是在飼料中放入過多的高濃度魚肝油， 使魚類肌肉退化變形而死亡。
3、維生素A缺乏症
魚肉記憶體在一種破壞維他命A的酶， 如以大量的魚肉為飼料時， 會使魚類發生貧血而引致死亡。 營養不良造成的營養障礙， 目前仍無適當的治療方法。 唯一的辦法是供給多種不同的食物， 避免營養不良。
