藻類在發生以後, 雖然有方法可以處理, 但多曠日費時, 又不一定可盡除, 對於栽種水草者的信心興趣, 會大打折扣, 因此建議在發生前作有效的預防。
1、建立健全的過濾系統, 濾材定期清理更換。
2、定期換水(每週換水25%-30%), 換水前做水處理, 除氯並用紫外線殺菌燈將藻類孢仔去除。
3、在設缸初期過濾系統尚未建立之前(約2-3周內), 先不要急著放魚。
4、放養魚只數量不可過多(燈科魚以一公升水一條為基準)。
5、餵食飼料量不可過多(飼料中含有大量的氮及磷, 是藻類最喜歡的養份)。
6、調整適當光源配置及光照量。
7、添加有機性適量肥料(一般化學性肥料添加于水中很容易離子化, 肥效發揮快速, 如果水草未能有效吸收利用, 將成為藻類的養分)。
8、事先放養藻蝦(兩尺缸建議放養約三十只藻蝦)、小精靈、青苔鼠、飛狐、黑茉莉(茶壺)等食藻生物將可有效抑制藻類。
9、密植水草, 底砂不要暴露照到光線。
10、靠近底床之老葉要修剪, 以免附著藻類。