由於水草和陸生草類的生活環境發生了很大的變化, 進化論需要他們在生理結構上也跟著變化, 以適應環境, 生存下來。 和陸生動物與水生動物的差別一樣, 空氣和密度的大不同是導致他們變化的根本。
首先表現在水生植物的通氣組織發達。 植物也是要呼吸的, 就好象魚有鰓一樣, 水草也有著非常發達的通氣組織, 以確保其呼吸作用的正常進行。
另一個方面由於水的密度大, 水草不用費太大的力氣就可以直立起來, 也就造就了他們相對陸生植物更弱的機械組織,
水草吸收營養相對陸生草就更簡單了, 他們甚至表皮等組織都可以從水中吸收營養, 不一定要依靠根的作用了, 所以跟的吸收營養作用就減弱了, 但是也不完全是廢物, 根的作用更多的是固定植株, 因為水流中要固定植株要比陸地上花費更大的精力。
當然水草的繁殖方式也發生了很大的變化,
因為在空氣中傳播花粉和在水中是不同的,
其實更多的植物是採取了營養繁殖的方式,
這樣的繁殖速度更快,
更利於自己物種的發展。