除了規律性的換水外, 我們不能沒有一套設計精良的過濾設備。 它必須執行以下三種功能:
1.將水面上的浮游物移走。
2.它必須含有過濾材質(即過濾棉), 細菌可以附著在上面, 篩檢程式因而又具有另一項生物性功能。 在水族箱中, 我們發現大量的細菌, 隨時準備將來自魚、水草及殘留食物的廢物消耗或處理掉。 它們支援了水族箱的系統, 同時又是維護魚只健康的重要因素, 僅次於局部換水。
3.提供水族箱中水的流動或迴圈功能。 許多魚類喜歡水的流動或輕緩的水流,
一船含過濾棉的小型篩檢程式, 都可以選擇。 不過, 所有含過濾棉的過濾匣, 需要經常的清洗(最好是換水時一起處理), 因為它很容易堵塞住。
堵塞時, 篩檢程式操作時會有耗氧現象而無法達成執行水迴圈的功能。 清洗過濾棉時, 只能用溫水, 而且不能完全洗淨或沖洗, 以免破壞附著在上面的細菌。