過濾的目的是儘量減少殘渣腐屑等有機物質的積累， 減少換水及清潔的次數。 篩檢程式的原理是利用缸水流經濾材時產生的過濾功能。
構造與作用
習慣上按廢水處理原理的不同， 將水族箱過濾系統分為機械過濾、生物過濾和化學過濾3大類。
機械過濾（物理過濾）是降低水體混濁度的一種水質淨化途徑。 水中微細的無機物質、有機物以及部分活的微生物通過絮凝作用， 逐漸凝結成肉眼可見的凝聚體而懸浮或沉積在水中引起水質混濁。 這些凝聚物質的大量存在， 不僅會降低水體透明度而影響觀賞效果，
機械過濾的功能是把大顆粒、大塊粘狀物等阻擋下來。 過濾結構為具有良好透水性、具較密孔隙的過濾材料（如泡棉、羊毛氈、砂石等）。
生物過濾包括很多重要的生化過程， 最重要的是給硝化細菌提供一個良好的生長、繁殖溫床， 讓硝化細菌能夠迅速地大量生長、繁殖， 充分發揮其氧化氨鹽和亞硝酸鹽的作用。 生物篩檢程式的結構特點是佈滿了大小不同的孔隙， 大孔隙讓水順暢地流過， 小孔隙提供了極大的表面積， 供消化細菌附著、生長、繁殖。 它的整體組織不必很大， 使用時可疊加堆放。 生化棉、生化球、生化塊、塑膠絲、陶瓷環、珊瑚砂（海水用）等是組成生化濾器的好材料。
化學過濾（含吸附過濾）是以化學反應方式來消除水中的不穩定物質的方式。 這些物質是游離的或以化合物形式存在的。 化學反應後無毒的物質沉澱於水族箱過濾系統的底部被物理性濾材除去， 或被另外一些無害或毒性較低的元素所替代（置換）。 水質穩定劑、pH調整劑、水質沉澱劑及其它一些化學製劑等都是化學濾材。 活性炭也是一種化學過濾材料， 具有脫色、除臭的功能， 但要定期更換。
設計與種類
產生流經濾材水流的方式有2種：利用氣泵所產生的水泡帶動水箱裡的水流經濾材；利用潛水泵或抽水泵將水抽入篩檢程式中， 通過濾材。 依篩檢程式在水族箱上的位置、過濾功能及物件的不同，
①底部篩檢程式 箱內底面式篩檢程式的過濾板設於水族箱底部， 板上留有插放通氣管的孔洞， 插上塑膠管。 過濾板上面鋪放砂石（珊瑚砂、貝殼、河砂均可）。 塑膠管連接充氣泵， 充氣時， 帶動水流經過砂石， 一方面打氣充氧， 一方面達到過濾的效果。 另一種是把過濾砂床設置在水族箱外， 用水泵或氣泵把水輸送到篩檢程式， 過濾後再回到水族箱。
底部篩檢程式的隔板材料要質地堅硬， 具有一定的承受力， 化學性質不活潑， 不會在水中發生化學反應而污染水質。 隔板上有滲水的微孔， 濾水孔的大小以水可滲過而沙不能通過為宜。
過濾砂床的砂礫應選擇質地堅硬、化學性質穩定的砂礫作濾砂材料， 如石英砂、溪砂等。 砂粒應大小均勻， 形狀不規則， 表面稍粗糙， 直徑3～5㎜/粒， 這樣可增大硝化細菌的黏附面積。
從過濾效果來看， 砂床的面積越大越好。 濾砂層的深度不宜過深或過淺。 硝化細菌在砂床中的分佈以表層和底層較多， 中層較少。 硝化作用主要發生在5㎝ 內的表層砂床（占90%），
底面式篩檢程式的缺點是重量重， 體積大， 換水及清洗砂石不方便， 尤其對栽種的水草易損傷其根。
②上部篩檢程式 上部篩檢程式安放在水族箱頂部， 用水泵將水抽至篩檢程式中過濾。 這種過濾箱為長方形， 內放活性炭或生化過濾球（過濾棉、生化棉、過濾砂等）， 上面鋪一層濾棉（海棉）組合成水層過濾層。 當接通電源後， 水族箱內的水被吸入過濾箱內， 通過過濾層再流回水族箱中。 根據水質的渾濁度定期清洗過濾材料， 防止過濾層中的空隙間因積聚過多的垃圾或污垢而影響水的迴圈流動和過濾效果。 箱頂篩檢程式未設增氧設備， 雜音小，清掃魚缸非常方便，但濾材所產生的硝化細菌略少於箱底式篩檢程式，過濾空間小，養魚數量不能太多。
③外置篩檢程式 外置式篩檢程式又有外部吊掛式篩檢程式和下部篩檢程式等多種形式。外部吊掛式篩檢程式是將篩檢程式裝置吊掛在水族箱側面或上方，以潛水泵把水抽進濾槽內，經濾材濾淨後流回水族箱。這種篩檢程式的優點是清洗容易，使用方便，但不易生長消化細菌，過濾功能遠不如底部篩檢程式，最好結合使用。
下部篩檢程式安裝在水族箱的下部，用管道與水族箱上部相連，下部空間大，可放大面積的篩檢程式，內放多種高效的過濾材料。還有一種外部篩檢程式是浸溢式的。
④內置篩檢程式 內置式篩檢程式（.沉水式篩檢程式）將裝置沉入水中，利用潛水泵直接吸水入過濾槽，經濾槽中的濾材及其上的消化細菌過濾後流回水族箱。它由一個內含過濾材料（如濾棉、活性炭和陶瓷濾材等）和水泵組成的封閉式組成。此種篩檢程式體積小，噪音低，佔用水族箱空間有限，容易管理和裝配維修，但處理的水體和濾材的清洗時間間隔較短，只能用於較小型水族箱中。市售的PJF、PJI系列，黑鑽系列，303、403系列等均屬此列。
⑤滴流式篩檢程式 其原理是：水族箱的水由上、中、下三個部位分別進入溢流管（又稱水族箱的排水管和定位管），流到下麵的過濾槽中。過濾材料由上至下依次為：過濾棉→生化球（或生物石）→砂（陶瓷珠）→淨水貯藏箱（可放臭氧、紫外殺菌燈、蛋白分離器等）→小袋活性炭（可隨時取放）。滴流式篩檢程式多層多途徑（物理、生化、化學）過濾，過濾效果好，在海水水族箱的過濾系統中廣泛使用。
⑥混合式篩檢程式系 指將不同的過濾方式結合使用，如下部篩檢程式（其中又採用滴流式、幹/濕式、呼吸式）與內置式篩檢程式合用，底部與外部篩檢程式合用等。
⑦蛋白質分離器（泡沫篩檢程式）（protein skimmer） 其基本原理是利用表面張力的吸附力除去水中雜質和有機蛋白質。它主要由氣泡發生器（如氣泵）、接觸器、泡沫清洗裝置等組成。噴氣嘴排出的氣泡在接觸室內徐徐上升，不斷與水體接觸，水中的極性有機雜質逐漸地吸附在氣泡表面，並在泡沫室內形成泡沫。泡沫不斷積累並上浮進入清洗器，及時清除清洗器中的泡沫，可清除水族箱中部分雜質。過濾後的潔淨水由泡沫室的出水口流回水族箱。蛋白質分離器必須配合使用臭氧機。
還有一種結構簡單、清洗方便的小型有機玻璃泡沫篩檢程式，其大小與內裝式砂床篩檢程式相近。使用時，由噴氣嘴排出的氣泡在接觸泡沫室內與水中的極性有機雜質吸附聚合，形成泡沫。過濾層（裝有海棉或其它濾材）將泡沫收集在接觸泡沫室內，潔淨水則透過過濾層，經出水口流回水族箱。當篩檢程式中的泡沫積累到一定數量時，可取出濾材，清洗後重複使用。
⑧超級濾可達海綿篩檢程式 它是生物培養海綿篩檢程式，其主要優點是在充分過濾的同時培養了大量硝化細菌，可以減少NH3、NO2等劇毒物。它還有無噪音、高溶氧量、不阻塞、面積大等優點，廣泛用於七彩神仙魚等魚類的飼養中。
雜音小，清掃魚缸非常方便，但濾材所產生的硝化細菌略少於箱底式篩檢程式，過濾空間小，養魚數量不能太多。③外置篩檢程式 外置式篩檢程式又有外部吊掛式篩檢程式和下部篩檢程式等多種形式。外部吊掛式篩檢程式是將篩檢程式裝置吊掛在水族箱側面或上方，以潛水泵把水抽進濾槽內，經濾材濾淨後流回水族箱。這種篩檢程式的優點是清洗容易，使用方便，但不易生長消化細菌，過濾功能遠不如底部篩檢程式，最好結合使用。
下部篩檢程式安裝在水族箱的下部，用管道與水族箱上部相連，下部空間大，可放大面積的篩檢程式，內放多種高效的過濾材料。還有一種外部篩檢程式是浸溢式的。
④內置篩檢程式 內置式篩檢程式（.沉水式篩檢程式）將裝置沉入水中，利用潛水泵直接吸水入過濾槽，經濾槽中的濾材及其上的消化細菌過濾後流回水族箱。它由一個內含過濾材料（如濾棉、活性炭和陶瓷濾材等）和水泵組成的封閉式組成。此種篩檢程式體積小，噪音低，佔用水族箱空間有限，容易管理和裝配維修，但處理的水體和濾材的清洗時間間隔較短，只能用於較小型水族箱中。市售的PJF、PJI系列，黑鑽系列，303、403系列等均屬此列。
⑤滴流式篩檢程式 其原理是：水族箱的水由上、中、下三個部位分別進入溢流管（又稱水族箱的排水管和定位管），流到下麵的過濾槽中。過濾材料由上至下依次為：過濾棉→生化球（或生物石）→砂（陶瓷珠）→淨水貯藏箱（可放臭氧、紫外殺菌燈、蛋白分離器等）→小袋活性炭（可隨時取放）。滴流式篩檢程式多層多途徑（物理、生化、化學）過濾，過濾效果好，在海水水族箱的過濾系統中廣泛使用。
⑥混合式篩檢程式系 指將不同的過濾方式結合使用，如下部篩檢程式（其中又採用滴流式、幹/濕式、呼吸式）與內置式篩檢程式合用，底部與外部篩檢程式合用等。
⑦蛋白質分離器（泡沫篩檢程式）（protein skimmer） 其基本原理是利用表面張力的吸附力除去水中雜質和有機蛋白質。它主要由氣泡發生器（如氣泵）、接觸器、泡沫清洗裝置等組成。噴氣嘴排出的氣泡在接觸室內徐徐上升，不斷與水體接觸，水中的極性有機雜質逐漸地吸附在氣泡表面，並在泡沫室內形成泡沫。泡沫不斷積累並上浮進入清洗器，及時清除清洗器中的泡沫，可清除水族箱中部分雜質。過濾後的潔淨水由泡沫室的出水口流回水族箱。蛋白質分離器必須配合使用臭氧機。
還有一種結構簡單、清洗方便的小型有機玻璃泡沫篩檢程式，其大小與內裝式砂床篩檢程式相近。使用時，由噴氣嘴排出的氣泡在接觸泡沫室內與水中的極性有機雜質吸附聚合，形成泡沫。過濾層（裝有海棉或其它濾材）將泡沫收集在接觸泡沫室內，潔淨水則透過過濾層，經出水口流回水族箱。當篩檢程式中的泡沫積累到一定數量時，可取出濾材，清洗後重複使用。
⑧超級濾可達海綿篩檢程式 它是生物培養海綿篩檢程式，其主要優點是在充分過濾的同時培養了大量硝化細菌，可以減少NH3、NO2等劇毒物。它還有無噪音、高溶氧量、不阻塞、面積大等優點，廣泛用於七彩神仙魚等魚類的飼養中。
