水草的病原體對水草皆有感染性, 但水草病害的發生並非是病原體與水草間的單純關係。 環境中的非生物及生物因數對病原體的致病力及水草的抗病力均有直接的作用。 當水中的環境不利於水草的生長, 如水溫過高或過低、光照不足、營養元素過多或缺乏、PH及硬度不適、施用化學藥劑、螺類或者人為傷害等情況時使水草抗病力降低, 這樣便增加了病原體致病的機會。 病原體利用自身的能力直接由表皮細胞侵入水草體內, 或經由水草上的自然開口或傷口侵入。 每一種病原體都有一定的侵入途徑,
病原體侵入水草的植物體後便與水草形成一種寄生關係。 當水草的抗病力降低或條件適合於病原體生長時, 病原體便大量繁殖, 數目呈幾何級數增加。 這些病原體依靠水草體內的營養維持其生長、繁殖, 水草細胞內的代謝作用被病原體所分泌的毒素、激素等干擾, 水草細胞內的物質不斷被破壞、消耗, 或是植物體內營養物質輸導被阻塞, 導致水草不規則運用能量, 並產生各種病害症狀, 如葉片捲曲、植株腐爛等。 大部分病原體僅能局部感染, 但有少部分病原體既能局部感染又能全株感染。
局部感染的病原體一般感染部位僅限於根、莖、葉等的某一部分,