1.腐爛病
腐爛病是一種感染性的病害，
病原屬於一種細菌。
此病菌感染水單後，
葉片上起初出現水漬狀褐斑，
後漸發黃，
乃至全株葉片呈纖維狀溶于水中，
若與健康葉相接觸，
很快就會傳染。
導致此病發生的原因，
主要是水草在運輸途中，
因溫度過高，
促使細菌滋生而感染。
購買者買回水草時，
將感染疾病的植株混雜在健康植株中。
如果不及時清除，
就植於水箱中，
病菌很快會傳染開來。
防治的方法， 一是要及時剪除感染疾病的葉或莖。 若是叢生型水草， 去掉病葉後， 隔開放在另一容器裡， 並觀察其發病的進展，
2.水羊齒病
水羊齒病主要發生在鐵皇冠、黑木蕨等水生羊齒類水草的葉上，
病原也是一種感染性的細菌。
被感染的葉類或邊緣部分，
呈現半透明狀的淺褐色斑塊，
與健康植株接觸後，
易於感染。
發生此病的原因與水溫偏高有關。
故防治此病就時應及時剪除病葉，
然後降低濕度至20℃以下為宜；並精心養護，
以增強植株本身的抗病能力。
3.椒草病
椒草和其他水草相比， 因植物體抗病力較差， 而容易感病。 病原是一種細菌。 感染疾病植株的葉片邊緣或尖端， 呈現出半透明狀的淡褐色斑塊， 以後慢慢地溶于水中。
防治方法主要是降低水溫， 並頻繁地換水， 去掉病葉或病株， 減少病原。 因水箱內有魚類等生物， 水草發病不宜採用藥物治療。
