一、綠水：
綠水又稱水華或藻華，
通常是單細胞綠藻（如小球藻）過度繁衍所造成的景象，
這種藻類形成的原因，
主要是水中累積有過量硝酸鹽及磷酸鹽之故，
其繁殖力相當快速，
能在理想光環境及營養環境中，
只需半天時間，
即可由一個小球藻細胞，
繁衍出幾兆個細胞來，
使清澈的水，
立即轉為綠色綠水的出現不會釀成大害，
所以不用擔心。
在水產養殖界，
放養魚類之前，
通常會在養殖池先培養出綠水（俗稱養水），
以預防養殖初期，
發生氨的毒害反應，
因為綠藻可以吸收氨（銨）為氮肥。
雖然綠水形成得快，
另外， 使用紫外線殺菌燈處理綠水， 大約不到一週時間， 也可以獲得有效控制， 但要徹底解決這問題， 還是以水中不能累積過量硝酸鹽及磷酸鹽才行， 否則很容易又會再度滋生。
二、膜狀藻
膜狀藻主要為藍綠藻種類，
通常生長在水草葉片、石頭、缸壁或底砂表面上，
其顏色常為藍綠色，
偶而為黑、紫或棕色。
最容易在水族缸設置之初出現，
或換水頻率過高的水族缸也較易產生。
它們特別具有危險性，
藍綠藻是一種介於細菌與藻類之間的「原核微生物」， 過去被歸類為藻類， 但有人主張應改歸類為細菌才適當， 因為它與屬於「真核微生物」的藻類為並不相同， 具有細菌的某些特徵， 所以也可以稱為「籃細菌」， 能進行細胞分裂生殖， 繁殖速度相當快。 可視為屬於一種尚未完全由細菌演化為真正藻類的「過度生物」， 不同於一般細菌的是， 它的細胞中含有葉綠素， 因此能進行光合作用， 自營生活。
這種藻類在硬度較高的水域較易發生，
比一般藻類更能耐高水溫，
其生命力及繁殖力相當旺盛，
但可利用除藻劑或消毒殺菌劑消
除。
三、絲狀藻
絲狀藻通常屬於綠藻種類，
因藻體呈絲狀而得名，
品種很多且形態相似，
有時候用肉眼不容易辨識。
主要附著生長在水草葉片及石頭上，
以綠色品種居多，
外形多半為棉花狀、線狀、或刷狀。
它們的生長條件與水草幾乎相同，
很容易在水草缸生長，
可稱得上是水草缸的「常客」。
絲狀藻形成的原因，
大部分都是附著於水草葉片入侵的，
真正屬於水族缸自生的反而比較少，
處理時， 可以用手或適當的工具將絲狀藻移走， 或放養藻食性動物， 如大和藻蝦協助消除， 必要時使用除藻劑會有更迅速的效果。 另外， 勤換水， 藉以稀釋過剩營養鹽的濃度， 則是抑制其繼續擴散的有效方法。
四、青苔
生長在水族箱玻璃或缸中石塊表面上綠色的膜片狀藻類， 通常 是一種俗稱"假小石蓴藻"的綠藻 ， 這種藻類即一般人所稱之青苔， 能廣泛適應於各種水質條件， 在溫度5-36℃，
青苔的繁殖速度十分快速， 尤其在有機營養物質豐富的水中更是常會大量滋生。 如果水族缸正面的玻璃長滿青苔， 整個水草景觀將被遮擋而無法透視， 所以會嚴重影響水草景觀的觀賞品質。 雖然利用普通擦拭法很容易消除， 但是要想根除卻不容易， 再生的機率相當高， 因此常讓人感到頗為困擾。 要清除青苔， 以放養除藻動物的方法最安全而有效， 像小精靈、黑線飛狐、白玉飛狐等魚類都能為您協助清除。 尤其是以放養笠螺最具成效， 只要放養1-2隻笠螺， 並且能讓牠們舒適生活其中， 就幾乎可以不用再擔心青苔問題了。
五、黑毛藻
黑毛藻是最常見的毛皮狀藻類，
長約0.3公分，
大部分叢生於水 草葉緣，也會密密麻麻地長在水族缸內任何固體表面上 ，長相非常不討人喜歡。一旦在魚缸內著生，特別具有破壞力，要讓它自然消失，幾乎是非常困難之事，所以常令人感到十分頭痛,其發生的原因通常是水體中磷酸鹽過量，或養分不均衡使然。
黑毛藻是黑色的藻類，幾乎能直接或間接利用所有可見光，其光合作用的效率為水草或其他藻類所難望其項背者，以致在任何光質及光度下，它依然可以生存得很好。它能直接利用水中的溶氮（DN）為氮肥，所以在完全沒有氮肥（如硝酸鹽及銨鹽）的情況下 ，也可以正常生長，由此可見其生命力強韌的一般。
過去只要發現水草長出黑毛藻時，都是立即利用剪刀把長藻的葉片直接剪掉，以儘可能把它從水族缸徹底移除，不過它的孢子仍有再度萌發的機會，實在很難達到根絕的目的，縱使放養藻食性動物協助清除，但效果並不明顯，甚至使用一般除藻劑也難於對抗，因此許多人曾為此而翻缸。所幸，更有效的除藻劑（如TBS黑毛藻剋星）問世之後，大約在兩三星期的療程中，就可以把它消除殆盡，所以它的威脅性已經大為降低。
六、矽藻
矽藻在水草缸也是常見藻類之一，不過出現的機率，比上述藻類要來得少一些。在水族缸鮮少有大規模矽藻出現，通常只是局部生長在水草向光的葉片、見光的砂層表面，或更多情況是長在缸壁上。外觀呈不規則膜片狀或泥狀，由於呈褐色的，有許多人也稱之為「褐藻」。 促使矽藻滋生的原因，最常見的是光線不足，水中含氧量過低 ，水質偏鹼性，過濾系統不良等因素所造成的，反而與肥料過剩的關係較少，所以矽藻也可能發生於養分貧乏的水族缸中。
當發現有此種藻類生長時，首先可以從加強光照，以及健全過濾系統等措施著手改善，也許即能在短期內逐漸讓它自動消失。如果沒有明顯改善，則可以放養藻食性魚類及笠螺來協助清理，或使用除藻劑給予清除，可能更迅速有效。
黑毛藻是黑色的藻類，幾乎能直接或間接利用所有可見光，其光合作用的效率為水草或其他藻類所難望其項背者，以致在任何光質及光度下，它依然可以生存得很好。它能直接利用水中的溶氮（DN）為氮肥，所以在完全沒有氮肥（如硝酸鹽及銨鹽）的情況下 ，也可以正常生長，由此可見其生命力強韌的一般。
過去只要發現水草長出黑毛藻時，都是立即利用剪刀把長藻的葉片直接剪掉，以儘可能把它從水族缸徹底移除，不過它的孢子仍有再度萌發的機會，實在很難達到根絕的目的，縱使放養藻食性動物協助清除，但效果並不明顯，甚至使用一般除藻劑也難於對抗，因此許多人曾為此而翻缸。所幸，更有效的除藻劑（如TBS黑毛藻剋星）問世之後，大約在兩三星期的療程中，就可以把它消除殆盡，所以它的威脅性已經大為降低。
六、矽藻
矽藻在水草缸也是常見藻類之一，不過出現的機率，比上述藻類要來得少一些。在水族缸鮮少有大規模矽藻出現，通常只是局部生長在水草向光的葉片、見光的砂層表面，或更多情況是長在缸壁上。外觀呈不規則膜片狀或泥狀，由於呈褐色的，有許多人也稱之為「褐藻」。 促使矽藻滋生的原因，最常見的是光線不足，水中含氧量過低 ，水質偏鹼性，過濾系統不良等因素所造成的，反而與肥料過剩的關係較少，所以矽藻也可能發生於養分貧乏的水族缸中。
當發現有此種藻類生長時，首先可以從加強光照，以及健全過濾系統等措施著手改善，也許即能在短期內逐漸讓它自動消失。如果沒有明顯改善，則可以放養藻食性魚類及笠螺來協助清理，或使用除藻劑給予清除，可能更迅速有效。
