魟魚的常見疾病主要有細菌性☆禁☆感染、寄生蟲感染、腸胃炎、細菌性鰓病、白頭白嘴病、鰓黴病、水黴病等等。 主要是受到水質環境， 飲食餌料等因素的影響。
細菌性☆禁☆感染， 主要原因為擦傷及發情時的咬傷所造成， 而出現潰瘍， 出血， 黴菌附生等情況， 治療可投治菌抗生素。
寄生蟲感染， 相對於國內的魟魚， 進口個體， 體表及體內有可能會帶有寄生蟲， 因運輸緊迫， 體質虛弱， 如放任不管， 寄生蟲會大量系列而危害到魟魚。 此外， 不健康的食物餵養也會導致魟魚出現寄生蟲疾病。
腸胃炎， 可統稱為內臟腸炎病變。 魟魚得了體內蟲， 初期看不大出來， 因為還會正常進食， 可是後來就會發現長不大， 逐漸食欲變差到不再吃。 雙眼中間凹陷， 尾骨凸起， 日漸削瘦而亡。
細菌性鰓病， 發病的病毒是粘液菌， 屬於格蘭式陽式細菌。 發病的魟魚大部分皮層組織潰瘍、鰓充血、鰓爛。
鰓黴病， 為鰓黴屬。 發病的魟魚孢子散落在水中時， 便粘附在魚鰓上， 侵入其組織裡生長， 發育成菌絲， 然後不斷的分枝， 病情嚴重時鰓絲變成粉紅色， 出現貧血狀態， 呼吸機能嚴重地受到阻礙， 更為嚴重的會導致魟魚直接死亡。
水黴病，
水黴病又稱棉花病，
患病的魟魚體表傷口處滋生出棉花狀物體，
特別是在剛進口魚尾部毒刺等地方最常見。
由於不正當的捕撈，
或者在運輸過程中弄破魚刺，
進而細菌感染，
就容易導致魟魚患上水黴病。
