花面蟾龜是小型的水龜品種, 通常來說背甲的顏色是黑色或是深色, 一般來說, 龜背甲顏色的深淺與陽光的照射程度有關,
花面蟾龜的背甲灰褐色, 呈橢圓形, 頂部扁平。 腹甲灰黃色, 每塊盾片上無斑點, 間喉盾將喉盾隔開, 但不完全隔開肱盾。 頭較寬大, 頂部呈灰色, 較扁平, 具鱗片, 眼睛後部有2條淡黃色條紋, 延伸至頭頂後部, 喉部、頸腹部灰白色, 下頜具1對灰白色觸角。 四肢背部和腹部均呈灰色, 指、趾間具有發達的蹼, 前肢5爪, 後肢4爪。 尾短。
花面蟾龜的背甲較小, 成體最大僅為20cm, 成體的性別也很容易區分, 通常雄龜的腐甲是凹進去的, 尾巴也比雌龜的要更長更大一些。