藻類篩檢程式
許多藻類不只是非常美麗、具有吸引力， 而且也是十分有效的篩檢程式。 在良好的環境下， 它們會繁殖得非常茂盛， 大量蔓生的枝葉會使所有的無脊椎動物都窒息而死。 尤其是蕨藻科的葡萄藤會將根伸入珊瑚中， 使它們無法充分地自然成長。
可以將藻類放在一個小型的附屬水族箱裡， 它的容量可與水族箱是一樣大， 或至少要有水族箱容量的10%到20%， 這種藻類篩檢程式通常放在較低的位置， 底層覆蓋一層珊瑚沙和碎貝殼。 將未過濾的水首先流進藻類篩檢程式，
因為藻類篩檢程式並不能清除水中的微細物質， 只能進行一些生物性的分解工作， 例如：主動地參與氮化合物、碳酸鹽和硝酸鹽等的分解過程。 藻類篩檢程式也必須接受強光照射， 但此處適用的照明原則與一般水族箱大不相同， 藻類篩檢程式每天至少要光照14到16小時。
在維護藻類篩檢程式的時候， 必須特別注意：避免它們繁殖過剩， 導致過度膨脹的生長密度， 因而使所有藻類突然死亡， 這種藻類的“自身調節”對於水族箱的水質而言， 是一場嚴重的大災難。
在強光下， 藻類篩檢程式會使pH值上升到8.6至8.8之間， 此時必須加入二氧化碳來調節pH值， 以避免這種狀況發生。
在夜間， 藻類會消耗大量的氧氣，
為了使藻類篩檢程式能維持適當的功能， 鐵含量必須保持0.01mg/l。
原則上， 所有的線藻都很合適作為藻類篩檢程式。
二、動力篩檢程式
“動力篩檢程式”是指懸掛在水族箱上部或裝置在水族箱以外的外部篩檢程式。 水族箱內的水始終在篩檢程式裡迴圈， 其中的污染物質就會在篩檢程式中逐漸被分解。 不含污染物質的水離開篩檢程式後， 過濾材質中的污染物質濃度會逐漸地升高， 在此同時細菌也同樣在篩檢程式中進行分解，
但所有的動力篩檢程式都有一個嚴重的缺點。 如果是將動力篩檢程式放在封閉的系統中， 極有可能發生氧氣供應不足的問題。 這種情況常常發生在動力被切斷或是因技術問題而使得水供應(氧氣運輸)中斷數小時之久。 在這段時間內， 好氧性細菌會因缺氧而死亡， 而篩檢程式在4到5小時之內就會變成“有毒的炸彈”。 當重新啟動時， 會將它所釀造的有毒物質排放到水族箱中， 對魚類和無脊椎動物都會造成嚴重的危害。
在更換過濾材質時， 在篩檢程式中保留10%的份量， 這樣做的目的是要浸透更換的材質。 然而， 因為動力篩檢程式通常都太小了， 所以可不必理會這一點。 在水族箱中的每一個地方， 例如玻璃、裝飾物、導管和沙中都有好氧性細菌的存在， 只要水流重新注入， 它們就可以立刻生長在新更換的材質之中。
水流必須盡可能快速地流經篩檢程式， 也就是說， 水族箱中的水在1小時內至少必須通過篩檢程式1到2次。 只有利用這種方式， 才可以籍助篩檢程式和水流達到持續而安全的氧氣運輸。
三、過濾材質
過濾棉：過濾棉必須是人工合成的材料，
海綿：它們的表面區域廣大， 使得好氧性細菌可以很舒適地生長在其中。 利用海綿過濾時只有頂層會因有細菌的存在而能淨化水質， 所以使用於篩檢程式中的海綿不可以加以擠壓。 另外， 還應該使用淺色的過濾海綿， 這樣才可以從表面察覺污染和泥濘的存在。
珊瑚沙、碎珊瑚和碎貝殼：這些材料通常用在穩定pH值或增加水族箱中的碳酸鹽硬度的時候使用。 但碳酸鈣或緩衝物質只能在pH值小於7的環境中才能溶解， 所以上述材質只能用在水族箱中的機械式過濾中， 除非能供應二氧化碳， 特別是在使用珊瑚沙的情況下(表面區域較大)才可以使篩檢程式中的pH值降低，緩衝物質也才能夠溶解，碳酸鹽硬度也才會隨之增加。
生物球：由生物球的本質上來說屬於開放式，所以在篩檢程式突然終止時不必擔心有中毒的危險，而且也不必清理篩檢程式。然而，篩檢程式中的塑膠板必須籍著有效的預篩檢程式材質來加以保護，以避免被較大的藻類給阻塞住。
活性碳：海洋魚類養殖中最重要的過濾材質就是活性炭，因為沒有任何過濾系統、細菌或秘訣可以清除海水中因尿液和氨基酸所產生的黃色物質，而只有好的活性炭才可以做到。好的活性炭應具有下列的性質：維持中性的pH值；粉狀或顆粒狀的形式；具有廣大的表面積；完全無塵；易於除去氣體；處理時可配合使用網袋。
四、砂石篩檢程式
砂石篩檢程式指在水族箱中的砂石或珊瑚紗結合之過濾系統。由氣泵或回轉式抽水機將水吸入，籍著這種方式，使水進入另一個正式過濾或預過濾的系統，然後再回到水族箱中。砂石篩檢程式也經常單獨使用，如此篩檢程式所吸入的水就不必經過更進一步的處理，這個系統的重點在於清除底部的有機物質。由於水流總是朝向最容易通過的地方，所以在這些地方的總出水量通常都十分的高，因此氧氣可以充分地供應，而好氧性細菌的族群也會出現在這一層中，而底層的有機物質就會被氧化或者更快地被分解。大多數的系統在8到16個月之後就會出現阻塞，而停止其功能，此時就必須更換整個水族箱的底層，這就是砂石篩檢程式的缺點。
特別是在使用珊瑚沙的情況下(表面區域較大)才可以使篩檢程式中的pH值降低，緩衝物質也才能夠溶解，碳酸鹽硬度也才會隨之增加。生物球：由生物球的本質上來說屬於開放式，所以在篩檢程式突然終止時不必擔心有中毒的危險，而且也不必清理篩檢程式。然而，篩檢程式中的塑膠板必須籍著有效的預篩檢程式材質來加以保護，以避免被較大的藻類給阻塞住。
活性碳：海洋魚類養殖中最重要的過濾材質就是活性炭，因為沒有任何過濾系統、細菌或秘訣可以清除海水中因尿液和氨基酸所產生的黃色物質，而只有好的活性炭才可以做到。好的活性炭應具有下列的性質：維持中性的pH值；粉狀或顆粒狀的形式；具有廣大的表面積；完全無塵；易於除去氣體；處理時可配合使用網袋。
四、砂石篩檢程式
砂石篩檢程式指在水族箱中的砂石或珊瑚紗結合之過濾系統。由氣泵或回轉式抽水機將水吸入，籍著這種方式，使水進入另一個正式過濾或預過濾的系統，然後再回到水族箱中。砂石篩檢程式也經常單獨使用，如此篩檢程式所吸入的水就不必經過更進一步的處理，這個系統的重點在於清除底部的有機物質。由於水流總是朝向最容易通過的地方，所以在這些地方的總出水量通常都十分的高，因此氧氣可以充分地供應，而好氧性細菌的族群也會出現在這一層中，而底層的有機物質就會被氧化或者更快地被分解。大多數的系統在8到16個月之後就會出現阻塞，而停止其功能，此時就必須更換整個水族箱的底層，這就是砂石篩檢程式的缺點。
