牟氏水龜不常見, 外觀也沒有特別的豔麗, 捕捉也比較不容易, 所以市面見到的幾率不多, 數量也很少。
牟氏水龜體長3~41/2"(7.6~11.4cm)。 棕色, 頭部的兩側各有一處明顯黃色、橙色或略帶紅色的斑塊。 背甲淺棕色至紅褐色, 棱突微弱, 並依據年齡的不同, 或光滑, 或粗糙。 腹甲棕黑色, 沿中線處分佈有多少不等的黃色;沒有鉸鏈關節, 盾片12枚。 雄性腹甲凹陷, 尾粗, 肛門開口越出腹甲邊緣。
牟氏水龜重約84~140克, 平均長8.9~9.4釐米, 雄龜較大只, 幼龜只有2.7釐米長。 它們的頭部呈褐色, 在頭及頸的兩側都有鮮黃色、橙色或紅色斑紋。 它們的身體深色, 腳內側呈橙紅色。 龜殼呈圓拱形, 盾板上有環狀斑紋。 一些年長的或經常藏在粗糙地方的個體, 其龜殼會較為光滑。 一般龜殼呈黑色, 而每個盾板都有栗色照射般的斑紋。