野生環境下的馬達加斯加大頭側頸龜是雜食性動物，
人工飼養環境下， 馬達加斯加大頭側頸龜稚龜可以吃各種無脊椎動物、魚、顆粒狀的龜飼料和魚飼料。 以及大量的水生植物。 成龜則是植食性的， 如果給它們顆粒飼料和蛋白質， 它們也會接受。 對於成體來說， 無需定期提供高蛋白的食物。 可以每週投喂一到兩次顆粒飼料， 量不要多， 其中陸龜飼料的比例要明顯地多於水龜飼料（後者含有較高的蛋白質）。 水箱裡應該一直保持有充足的水生植物和綠葉蔬菜， 而且品種也要多樣化。
馬達加斯加大頭側頸龜是世界上最為溫和的水龜之一， 它們在游泳和覓食時的動作都非常優雅。
