蛋龜需要的生活環境較複雜, 但是大多數蛋龜喜歡深水的環境, 蛋龜是游泳高手, 且不怕人, 所以深水養蛋龜,
蛋龜的生活環境依據種類的不同而有所變化, 但就一般來說, 它們都喜歡流速緩慢或者是靜止的水域。 這些區域通常都有鋪著沙子和淤泥的鬆軟的河床, 生長著大量的水生植物。
特殊的生活環境, 可以導致複雜的交互關係, 甚至是在一些特殊的種和亞種之間。 這其中本質的內容包括底土層的類型, 植被的存在, 以及水體的流動, 而它們又和下述的因素發生相互的影響, 諸如, 食肉動物的多少, 生存環境的變更(自然因素或人為干擾), 和當地氣候條件的變化(例如:Webster, 1986, Christiansen等, 1989, 和Stone等, 1993)。 曬太陽的場地不是基本要素, 但當它們需要的時候,
據報導, 普通麝香龜(Sternotherus odoratus, 或譯密西西比麝香龜)會爬樹, 並慢慢地爬到離水面幾米高的樹枝上, 一旦受到驚擾, 就會跌入水中。 巨頭麝龜(S. m. minor)也有類似的傾向。 (Pritchard, 1979)而有些種類, 尤其是在乾旱地區的種類, 生活在一些臨時性的水域中。 在旱季, 它們會躲入泥漿中夏眠, 以等待下雨時再補充水份。