黑線飛狐最大的長度可以達到15釐米, 但由於他們的壽命可以超過10年, 所以一般在兩年內才能達到這個體型,
黑線飛狐魚鰭為透明或輕微乳白色, 並沒有任何黃色或帶紅色的光澤。 黑色條紋從鼻子延伸至尾部分叉處, 條紋邊緣為之字形(鋸齒形)。 當它感到緊張或在爭鬥的時候, 這條條紋的黑色會明顯消退。 身體下方為銀白色, 黑色上方並無亮條紋, 但整個身體上方為褐色並且每個鱗片邊緣都為黑色, 這使它從上方看下去為網狀的。 一些黑色邊緣的鱗片有可能生長在黑色條紋的下方。
黑線飛狐有一對細小, 向前的觸鬚, 在游泳或休息的時候, 它們折向頰部。 在年輕的魚中, 黑色長條紋也很容易見到, 但在它長度達到5~7釐米(2~3寸)之前, 並不能清晰看到其黑色邊緣的鱗片模樣及黑條紋的之字形邊緣。