平背麝香龜是小麝香龜屬裡比較有特點的龜, 麝香龜又被人們稱之為蛋龜, 主要的原因在於背甲像一枚雞蛋的殼,
平背麝香是小型的淡水龜, 背甲非常的平坦, 兩側的斜坡形成了一個大於100度的角度。 幼體時, 斜面的角度與高度的比率大約為9.5:1。 背部中央有一條比較鈍的、不太明顯的脊椎骨。 背甲前端兩側的緣盾略微呈鋸齒狀, 每塊脊椎盾甲都與後方盾甲前端交迭, 第1塊脊椎盾甲比較的長, 從不於第2塊緣盾相接觸, 另外4塊脊椎盾甲的寬度大於其自身的長度, 第5塊則向後方擴展。 背甲的顏色為黃褐色和咖啡色, 伴有黑色或咖啡色的斑點與條紋。
頭部的大小適中, 有不完全類似於鉤狀的上顎, 在橄欖色頭背部是完美的黑色網狀條紋和斑點,