日本石龜的游泳技術比較好， 所以在野外的環境中， 日本石龜喜歡生活在水裡， 偶爾也會爬到岸上來曬背。
日本石龜生活在池塘， 小河， 沼澤等水域， 每天大多數生活在水中， 有時會爬上岸曬太陽。 在炎熱的盛夏， 多數在上午和傍晚活動， 中午潛在深水中休息。 日本石龜石板水棲類的龜， 準備水族箱時要在裡面安排一塊陸地。 還要安置一個加溫燈， UV-B型的爬蟲燈對它們的健康十分有用。
日本石龜都是非常活躍的龜類， 生性好動， 所以在安排龜舍的時候儘量找一個大一點的飼養箱。 在亞熱帶和溫帶等地， 在一年中的某段時期要是能將這種龜飼養在室外的池塘裡， 它們會非常高興。
