由於紅尾蝶主要以食藻類、海綿珊瑚為主， 所以飼養紅尾蝶的時候就需要注意如何科學餵食。 有些紅尾蝶也會吃一些小動物及浮游生物，
一般常用的生餌就是冷凍蝦肉， 文蛤， 紅蟲， 豐年蝦這兩種比較不建議使用， 因為來自於淡水環境的細菌海水魚是沒接觸過且沒抗體的， 非要使用也一定要煮熟殺菌， 不會吃文蛤蝦肉的碟魚通常也不會吃紅蟲的， 紅蟲並不會比較好用， 而豐年蝦大多都水分營養成分不高， 經實驗海水寄身蟲皆無法度過冷凍環境所以寄身蟲的問題就不用擔心了。
給紅尾蝶訓餌的重點是食物要黏在他們熟悉取食的東西上面而不是食材， 一開始可以用小剪刀剪碎生餌混點高夠力S黏在殼上或者珊瑚骨上誘食， 馴餌也一定要使用“老師魚”，
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