扁尾陸龜外觀酷似蛛網龜, 並且在一段時間內, 人們一度認為扁尾陸龜是蛛網龜的某一亞種,
扁尾陸龜可生長至13.7釐米, 甲殼相當平坦, 甲殼後面邊緣是尖銳的鋸齒, 甲板的顏色是黑色的, 成長後會慢慢變成淺棕色, 甲與甲之間的邊緣會有淺棕色或黃色斑點。 背甲與腹甲之間沒有鉸鏈, 腹甲的顏色是黃色的, 有褐色的斑點, 斑點顏色較為暗淡。
頭部呈黃色而且有黑色斑點, 但不同的個體差異是很大的。 喙的上頜骨和下頜骨是黃色的, 四肢呈淺棕色的。 而尾巴是平的, 因而得出扁尾陸龜的名字。
扁尾陸龜早前是歸納為蛛網龜屬中蛛網陸龜的亞種, 其後才被獨立為蛛網龜屬中的另一種。 扁尾陸龜居住乾燥的落葉林中,