孟加拉巨蜥通體是呈灰色或灰綠色, 比較典型的特徵就是該蜥蜴身上帶有黃色的斑點,
孟加拉巨蜥的腦袋呈三角形, 在野生環境中, 雄性普遍比雌性超重42%以上。 鼻孔呈裂目狀, 位於眼睛至吻部間之中央。 可依體色及鱗片外形等特徵, 西部亞種及東部亞種有所區別。 成年孟加拉巨蜥一般都是灰色或灰綠色, 從下巴至腹尾部有灰黑色的斑紋, 這些標記通常中, 西部地區的深暗些, 東部地區的淺輕。 這些腹側標記通常隨著年齡的增長, 皮膚的顏色就變得較深。 在野生環境中, 錄得最重的雄性孟加拉巨蜥是7.18千克的重量。