埃及陸龜屬於地中海類陸龜在圈養條件下最小和最難伺候的品種之一。 由於它微小的體型和極其特殊的氣候要求,
埃及陸龜是北半球最細小的龜, 龜殼長度14.4釐米。 雌龜較雄龜為大, 雄龜較為幼長, 尾巴也較長埃及陸龜的龜殼高拱, 呈象牙色至淡金色至深褐色或沉黃色。 這種顏色是格洛格爾律, 可以幫助它們控制陽光所造成的影響, 較淡色的龜會留在沙漠中較長時間, 且也是在沙漠中有效的偽裝。 胸甲呈淺黃色, 腹部每片龜板都有兩個深色三角形。 它們龜板上深色的側緣會隨年齡而消失。 埃及陸龜的頭部及四肢都呈淡象牙黃色至黃褐色。
由於未確認的特徵, 建議的亞屬Pseudotestudo並未有效。 另有建議將埃及陸龜與緣翹陸龜組成Chersus屬,
內蓋夫的亞群因分散而成為獨立的納吉夫陸龜。 但是它們並不獨特, 與埃及陸龜在埃及滅絕的群落相符。 納吉夫陸龜是局部地區適應的形態, 而外表不同。 它們有可能是埃及陸龜的亞種。 由於基因流已經停止, 它們的保育方法須有不同的處理。