眼斑水龜的外觀與四眼斑水龜很相似, 很難區分和鑒別, 確實是這樣, 在正常情況下, 如果龜縮在甲殼內是區分不出來的,
眼斑水龜, 體型中等, 成年龜甲長14釐米左右。 頭背皮膚光滑, 灰棕色, 頭、背均佈滿棕黑色或鐵銹色蟲狀斑紋, 頭後兩側各有1~2對眼斑狀花紋, 有的頭頂還有蟲紋, 兩對眼斑分界不清。 背甲灰棕色, 較平, 具一縱棱。 腹甲平坦, 略與背甲等長, 前緣平切, 後緣略凹。 四肢灰棕色., 前肢外側具若干大鱗。 指(趾)間全蹼, 前肢5爪, 後肢4爪。 尾細。
眼斑水龜背面色深, 腹面色淺。 眼斑水龜, 頭頂的兩對眼斑界線清晰, 背甲呈棕色, 腹甲淡黃色並雜有黑色斑點。 其他略與眼斑水龜同。 體型適中。 上喙不呈鉤狀, 頭後側各有2對眼斑, 每個眼斑中有一黑點, 頸部有條縱紋。