亞馬遜泥龜在野生環境下是肉食性的龜, 但是在人類飼養的時候, 也會接受一些植物性的食物以及龜糧,
亞馬遜泥龜食性較廣, 稻穀、小麥、豌豆、小魚、蝦、昆蟲、蝸牛等均吃, 其中最喜歡吃的食物是小魚、蝸牛、玉米和稻穀。 人工飼養時, 為滿足亞馬遜泥龜生長所需要的各種營養, 避免因飼料單一而生長發育不良和產生厭食症, 應採用多種飼料, 如動物性飼料中的魚蝦、蝸牛、河蚌等和植物性飼料中的稻穀、小麥、玉米等。
要想讓亞馬遜泥龜充分地消化這些飼料, 在投喂飼料之前, 須先將玉米、豌豆等壓碎, 浸泡2小時左右, 其他大塊食物也須先切碎, 然後才投喂。 還須注意的是, 在亞馬遜泥龜生長的不同時期, 應根據其生長特點投以含不同營養成分的飼料。