擬鱷龜一共有四個亞種， 南美、中美、北美和佛州擬鱷龜， 其中以中美擬鱷龜的數量最為稀少。
中美擬鱷龜的整體顏色（包含腹甲、背甲及皮膚）比其他三個亞種要來的更深。 幼體之背甲顏色為深灰色到黑色之間， 緣盾之甲殼上有白點， 腹甲有白色斑點。 下頜有二對須狀突起顯的很特別、明顯。 與佛洲擬鱷龜相同的是在頸部和其他表皮上之肉刺又細又尖， 非常的明顯。 頭部較寬且很強壯、上部較平坦， 呈深褐色， 吻部較狹窄細長。
中美擬鱷龜背甲部份偏向長方形且無明顯之隆起， 第三椎盾最大， 占背甲長的25%。 腹甲前段占背甲長的40%以上。 此龜種外型看起來比其它亞種更顯得霸氣十足， 為四種亞種中數量最為稀少之龜種。 中美種群的甲殼基本為黑色，
