彩虹飛蜥在夜晚時的體色是不顯眼的灰色, 但是當太陽光照射彩虹飛蜥的體溫發生變化後,
彩虹飛蜥的特點是它帶白色的下腹部, 迷棕色的後腿和尾部有一條纖細的明亮度條紋到中間和6到7個深斑到一側的條紋。 有一些雌雄異體。 次級雄性, 雌性, 和幼體擁有一個橄欖綠的頭部。 一個藍色的身體和黃色的尾巴、頭這是佔有統治地位的雄性的特徵。 彩虹蜥蜴有一個大腦袋, 一條長尾巴, 完整發育的外耳孔和眼瞼。 這種蜥蜴也有邊齒, 不同類型的牙。 雄性蜥蜴的最大長度是25釐米, 雌性蜥蜴是20釐米(Harris 1964)。