造成藏獒脫毛的原因有很多， 比如寄生蟲感染、真菌感染、內分泌紊亂等等， 不同的病因治療方式也有很大區別，
一、寄生蟲感染
多發生於身體及背部。 相對來說， 簡單、小面積的寄生蟲感染是最容易治癒的， 導致脫毛的寄生蟲主要為蟎蟲， 病犬可見被毛稀疏、皮屑更多、可壓出蠟質樣皮脂。
治療時先剪掉炎症區及周圍的被毛， 用酒精等清潔並灶， 大面積炎症需用硫磺皂或洗髮劑洗澡， 去掉表面病皮， 局部使用低毒、高效、易滲透的藥物， 如石硫合劑、0.5%敵敵畏、敵百蟲等塗擦可望治癒， 如果犬伴發細菌感染應考慮局部或全部使用抗菌素治療。
二、真菌感染
多發生於頭部、四肢及腳上， 病犬可見脫毛、瘙癢， 實驗室診斷的確診率比較高， 單一的憑藉肉眼是無法判斷的。
治療首選藥物是灰黃黴素，
三、內分泌紊亂
多對稱的發生於腹肋、胸股部。 早期變化為色素沉著、多皮屑、被毛稀疏等， 隨後出現脫毛症。
治療有睾丸足細胞瘤的雄犬需摘除睾丸， 同時口服或注射睾丸激素。 卵巢機能紊亂的母犬應切除兩側卵巢或子宮。 試用甲狀腺素， 按每日0.4~0.8mg/Kg體重服用4~8周為1療程， 頭2周用藥量遞增， 以後遞減， 可收到較好的療效。
