很多人都會分不清魚缸水質變綠和水質渾濁， 其實這兩種情況是存在本質的區別的， 很多原因會導致魚缸水變綠，
紫外線殺菌燈可說是最常使用的方式。 活水蚤還來不及協助吞食綠水， 自己往往就已經變成了其他生物的佳餚；矽藻土篩檢程式（Diatom filters）價格昂貴， 也必須經常清理， 不怎麼符合經濟效益；化學藥品則是我們最不願使用的手段。
對於綠水的處置， 所建議使用遮光法過程如下：遮光三日， 每日換水50-60%， 同時關閉CO2的供給， 每日以每10公升相對1cc的方式添加戊二醛， 使用劑量是建議劑量的四倍）。 每日盡可能徹底清理藻類， 增加水面的流動以提供較多的氧氣。 三日之後開始施肥並供給CO2， 此時供給CO2要很小心， 另外執行每週兩次的換水， 直到綠水完全消失為止。
預防綠水最好的方法， 就是在修剪水草或翻動底床時， 配合適度的換水， 如此一來降低了NH4暴露劑量與時間， 這也是預防許多藻類萌發的最好方法。
