硝化細菌只不過是微生物循環系統中的一個環節而已, 何以小編只強調硝化細菌的重要性, 而不談其他淨水細菌對水質淨化的貢獻,
所幸這類細菌普遍存在於各種不同環境, 它們幾乎無所不在, 而繁殖速度相當驚人, 大部份的異營性淨水細菌, 在理想的環境只需幾十秒鐘即可自行增殖一倍, 一般只需二十幾分鐘即能增殖一倍, 因此業者用不著採取特別措施, 它們便可以在池水中自生及迅速繁殖。
反觀硝化細菌就不是如此, 它的繁殖速率很慢,
另一個重要的原因是硝化細菌是一種自營性的細菌, 這種細菌的特徵是不喜歡有機物, 如果有一大堆有機物的話, 反而會抑制它們的生長與繁殖。 因此它們無法像其他異營性細菌一般可直接寄生在池底的有機廢物之上, 而必須避開這些有機廢物, 這無形中會限制硝化細菌的居住環境, 若水中適合硝化細菌居住環境不是很多時, 它們的數量將很難增加。
就除銨的效率而言, 要消除幾個 ppm 的銨, 至少要有上百萬個硝化細菌才能達到目的, 所以硝化細菌除銨的效率並不高。 再加上硝化細菌的繁殖速率很慢, 以及池水中可居住的環境又少, 無法自生足量的硝化細菌, 以致硝化細菌就自然成了水產養殖的關鍵細菌了。