低溫、溫差過大、飲水不潔、食物變質等等， 都有可能導致龜患胃腸炎， 不同的發病原因， 治療的方式有所不同，
一、診斷方法
輕度病龜的便便稀軟、呈黃色、綠色或深綠色、有少量粘液， 並夾雜著不完全消化的食物。 嚴重病龜的便便稀水樣粘液狀， 呈醬色、血紅色， 並夾雜著不消化的食物， 龜龜拒食。 或排泄奇怪的便便。
二、發病原因及處理方式
1.低溫下餵食、溫差過大、不適合龜的食物等引起的腸胃炎。
處理：採取停食的方法， 讓龜龜的腸胃排空並進行自行調整。 或口服生物製劑(如乳酸菌素片)， 幫助龜龜調整腸道菌群健全消化功能。
2.變質的食物、不潔的水質等引起的腸胃炎， 細菌感染的可能性大。
處理：口服或注射抗生素進行治療。 口服藥物可以選擇諾氟沙星或慶大黴素， 注射藥物可以選擇慶大黴素注射液、乳酸環丙沙星注射液。
3.不合理的飼養方法。
以陸龜為例：吃了富含水分而缺少纖維素的食物引起大便鬆散稀薄， 處理：適當控幹食物中的水分、調整食物結構、加大粗纖維植物的比例。
4.濫用、長期使用或大劑量使用抗生素引起的腹瀉， 偽膜性腸炎(抗生素腸炎)的可能性大。
處理：較輕的腹瀉， 口服生物製劑， 如乳酸菌素片， 調整腸道菌群健全消化功能。 嚴重的腹瀉， 需要口服或注射抗生素進行治療。 首選替硝唑， 次選甲硝唑。
5.常見寄生蟲引起的大便鬆散稀薄。
處理：口服打蟲藥物。 可以選用腸蟲清。
6.果凍樣等等奇怪的便便， 原蟲感染的可能性大。
處理：口服或注射替硝唑或甲硝唑， 首選替硝唑， 次選甲硝唑。
