荷花除了常用地下根莖（藕莖）繁育外， 亦可採用種子（俗稱蓮子）進行有性繁育， 由於採用種子有性繁育， 其後代變異性大。 因此在菜藕種植中， 為確保其固有的特性， 都不採用， 除進行有目的的科學雜交試驗用。 那麼在觀賞的荷花中， 為選育新的優秀品種， 常用此法進行。
由於雜交繁育荷花操作相對比較簡單， 出現新品的繁育週期亦不長， 只要掌握簡單的操作要領， 有興趣的花友均可進行。 為此， 下面就荷花的雜交， 播種， 繁育基本操作方法介紹如下：
一、荷花的雜交
1、能結實的荷花品種， 最基本的條件是雌芯發育應是正常的植株，
2、預先準備好鑷子， 標識牌， 塑膠薄膜袋， 紮帶等。
3、在荷花盛開的6月中旬~8月中旬， 於每天清晨， 當定向選定的植株的花朵剛半開之時， 對選做母本的花朵用鑷子小心夾除所有的雄芯， 在用鑷子夾取在選作父本的雄芯， 然後小心抖落花粉在母本的蓮蓬上， 然後套上塑膠薄膜袋紮緊， 作好標識， 約過了3天左右， 解開薄膜袋， 待蓮子充分成熟顏色變為黑褐色時， 及時採收曬乾， 作好標識， 放於通風陰涼處保存或放於家用冰箱的冷藏箱內保存。
二、種子的播種
1、於第二年的春天， 天氣回升轉暖氣溫相對穩定時（南方在4月份， 北方在5~6月份）， 原則上做到寧晚勿早， 取出種子， 認准其中凹端， 進行破殼， 少量的破殼， 可用手控住種子， 把凹端放在粗糙的水泥地面或砂輪平面上來回壓磨至露出裡面的種皮即可， 較多數量的， 可用手（最好用鋼絲鉗夾住種子）放在電動砂輪上磨破種子外殼， 但電磨時必須注意安全。
2、把已磨破種皮外殼的種子， 浸泡於20~300c水溫的保溫容器內（如保溫瓶內）， 使用的水應無油污等的清潔水， 使用自然水的水應放置24小時以上， 每天更換溫水一次， 3天后換入淺盆內， 白天放於日光下加溫， 晚上移至房間內覆膜保溫。 如家裡有養熱帶魚的魚缸時，
一般浸種3~4天后， 新葉長可達6cm左右， 並開始長根， 此時對開始發育較早的每天利用換水時， 分批挑出栽於育苗盆中。 最初的兩天最好放在有30~50%遮陽的地方緩苗， 以防止莖葉灼傷。
3、分栽用的花盆應在浸種時同時預備好， 盆徑可預測， 根據種子將來的植株大小， 選用20~30cm左右口徑的花盆， 按盆的高度裝田園土或稻田土1/2~1/3左右， 加適量的水， 把土搗至稀泥狀， 停清備用。
4、把已長葉3~4支時達分栽要求的種苗， 用手控住種身埋入分栽盆泥中， 以淹沒種子為度， 然後加水， 以不淹沒小荷葉為度， 考慮到生長所需每盆只種一株。 移至全日光下進行正常管理， 並注意水位變化， 水不夠時及時補水， 確保水位相對穩定， 待立葉長成時， 逐漸加滿水即可， 如管理得法， 當年即可見花， 且能當年長3~6支藕。
5、如天有日光保溫大棚條件的， 也可當年7~8月採種及時播種， 天氣較冷時， 移入大棚內， 保持一定的溫度， 也可當年開花結藕。
三、新品挑選類型
由於雜交的有性繁植的後代變異大， 其雜交後代在花色、花型、瓣數、株型及特性上均有所變化。 因此在當年開花後進行初選， 並作好標記。 對初選落選的及時淘汰， 對保留的品種在第二年3~4月份進行分藕培養。
