雖然阿富汗獵犬身體健康， 平時很少生病， 但這並不代表狗狗沒有氣人方面的問題， 犬主人要留意狗狗的皮膚方面的疾病。
在愛犬的皮膚問題上，
最常發生的就是異位性皮膚炎的問題，
而且好發在母犬身上，
從六個月大開始一直到七歲之前都很容易發生；此外，
在迷你愛犬身上，
還容易患有一種名為愛犬粉刺症的疾病。
愛犬的皮膚生性敏感，
很容易因為洗毛精清潔不完全或過敏，
而引發表淺化膿性壞死性皮膚炎，
或是因為對磺胺劑類型藥物過敏，
而造成皮膚發炎的現象；除此之外，
愛犬也容易患有糖尿病以及低甲狀腺功能症方面的內分泌問題。
在胃腸道方面， 則容易發生先天性肝門脈分流、以及出血性胃腸炎（通常好發於兩歲至四歲之間）。 這種出血性胃腸炎不是病毒造成的， 較容易發生在迷你型愛犬身上， 而就大型愛犬來說， 因為牠們對於維他命B12會有吸收不良的問題， 而且非常有可能會造成不再生性的貧血現象（通常好發於六周至十二周的狗狗身上）， 飼主要特別注意。
