水草缸雖然以草為主， 但是如果有魚的點綴那絕對是錦上添花， 對於新手來說水草缸適合養什麼魚是個非常要棘手的問題， 畢竟魚都不便宜， 能選擇合適的魚還是非常重要的。
水草剛種好的時候不要放任何魚只， 因為水草沒長好的時候吸收有機物的能力太差， 而魚只的排泄物中的有機物就會慢慢的滋生藻類， 因此這也是水草缸爆藻的原因之一， 而魚缸這時也不具備分解排泄物的功能， 會影響到水質， 也會對魚只的生存造成一定的影響， 所以， 投放魚只的最佳時機是， 水草缸中的消化系統穩定之後， 水質穩定， 水草生長好， 之後在進行飼養。
在思考水草缸適合養什麼魚的時候， 首先要想到它的功能， 因此可以在開缸初期投放一些以藻為食的魚只， 當然這個時候不要餵食飼料， 如果只吃飼料就會養成習慣， 之後也不會吃藻了， 所以放入缸中之後就讓魚兒只吃藻類就可以了，
現在來推薦幾種以藻為食的魚類， 第一種是黑線飛狐， 它是專門對付一些難處理的藻類， 必須須狀藻和絲狀藻， 所以是很好的選擇。
還有種魚叫小精靈， 它的清潔能力是大家公認的， 主要是對付一些蔓生藻和變異藻類， 但是因為其生性膽小， 一但受到驚嚇就會降低除藻能力， 還有一點就是小精靈的生命力較弱， 非常容易死亡， 所以玩家在選擇的時候需要多注意一下。
再來說說青苔鼠， 它又名泰國食苔魚， 長久以來被大家養來吃藻類。 但長大後會漸漸吃藻類以外的東西， 且會用吸盤去攻擊其它魚類，
下面在列舉一些常見的可以在水草缸裡養的魚。
第一種是燈科魚， 紅蓮燈、寶蓮燈、三線鉛筆、黑日光燈等， 都事宜在水草缸中飼養。
第二種是美人科， 石美人、紅美人、電光美人等。
第三種是鯉科， 三角燈、櫻桃燈、白雲山、小斑馬等。
第四種是鼠魚， 小精靈、月光鼠、滿天星鼠、紅頭鼠等。
第五種是南美短鯛， 荷蘭鳳凰、阿凱西、鳳尾、黃金短鯛、阿凱西短鯛、藍袖等。
第六種是鱂魚科， 黃金鱂、漂亮寶貝、孔雀魚、摩利魚等。
第七種是鬥魚科， 麗麗、珍珠馬甲等。
第八種是慈鯛科， 小型品種七彩鳳凰、紅肚鳳凰等。
第九種是異型魚， 熊貓異型魚、大鬍子異型魚等。
第九種工具魚， 這種魚主要是清潔水草缸的魚類， 如青苔鼠、黑線飛狐。
